Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT2P35908 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT2P35908 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT2P35908 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT2P35908 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT2P35908 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT2P35908 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT2P35908 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT2P35908 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT2P35908 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT2P35908 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT2P35908 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT2P35908 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT2P35908 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT2P35908 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT2P35908 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT2P35908 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT2P35908 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT2P35908 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT2P35908 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT2P35908 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT2P35908 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT2P35908 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT2P35908 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT2P35908 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT2P35908 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT2P35908 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT2P35908 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT2P35908 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT2P35908 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT2P35908 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT2P35908 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT2P35908 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT2P35908 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT2P35908 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT2P35908 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT2P35908 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT2P35908 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT2P35908 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT2P35908 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT2P35908 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT2P35908 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT2P35908 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT2P35908 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT2P35908 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT2P35908 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms