Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYH11P35749 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MYH11P35749 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYH11P35749 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYH11P35749 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYH11P35749 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYH11P35749 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYH11P35749 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYH11P35749 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYH11P35749 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYH11P35749 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYH11P35749 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYH11P35749 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MYH11P35749 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYH11P35749 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYH11P35749 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYH11P35749 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYH11P35749 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYH11P35749 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYH11P35749 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYH11P35749 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYH11P35749 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYH11P35749 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYH11P35749 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYH11P35749 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYH11P35749 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYH11P35749 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYH11P35749 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYH11P35749 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYH11P35749 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH11P35749 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH11P35749 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH11P35749 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms