Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF2P35227 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
PCGF2P35227 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PCGF2P35227 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PCGF2P35227 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCGF2P35227 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms