Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSP1P33241 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSP1P33241 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LSP1P33241 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSP1P33241 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LSP1P33241 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LSP1P33241 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
LSP1P33241 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LSP1P33241 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSP1P33241 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSP1P33241 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSP1P33241 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSP1P33241 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSP1P33241 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSP1P33241 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSP1P33241 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSP1P33241 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSP1P33241 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSP1P33241 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms