Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GBP1P32455 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GBP1P32455 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GBP1P32455 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP1P32455 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP1P32455 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP1P32455 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP1P32455 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP1P32455 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP1P32455 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP1P32455 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP1P32455 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP1P32455 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP1P32455 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP1P32455 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP1P32455 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP1P32455 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP1P32455 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms