Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 LINC02246-207ENST00000630354 524 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 ABCA1-201ENST00000374733 923 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 LYVE1-203ENST00000529598 936 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC103996.2-201ENST00000556763 915 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AL583859.2-201ENST00000634462 1127 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 CBR3-AS1-204ENST00000453159 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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HOXD11P31277 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 C15orf40-209ENST00000538348 561 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC069208.1-206ENST00000538905 832 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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HOXD11P31277 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 ADAL-204ENST00000562188 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 CTXN3-204ENST00000620385 1208 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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