Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms