Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA5P30532 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms