Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX2P28328 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PEX2P28328 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PEX2P28328 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PEX2P28328 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PEX2P28328 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX2P28328 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX2P28328 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms