Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 PLXND1-214ENST00000512744 2662 ntTSL 1 (best)15.31■□□□□ 0.045e-8■■■■■ 33.1
PTBP1P26599 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.085e-8■■■■■ 33.1
PTBP1P26599 PLXND1-211ENST00000506979 691 ntTSL 57.55□□□□□ -1.25e-8■■■■■ 33.1
PTBP1P26599 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.046e-7■■■■■ 33.1
PTBP1P26599 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.196e-7■■■■■ 33.1
PTBP1P26599 PHYKPL-211ENST00000494126 2297 ntTSL 1 (best)22■■□□□ 1.112e-10■■■■■ 33.1
PTBP1P26599 PHYKPL-209ENST00000489262 2780 ntTSL 219.95■□□□□ 0.782e-10■■■■■ 33.1
PTBP1P26599 PHYKPL-204ENST00000474052 1539 ntTSL 1 (best)17.5■□□□□ 0.392e-10■■■■■ 33.1
PTBP1P26599 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-10■■■■■ 33.1
PTBP1P26599 PHYKPL-210ENST00000493197 1969 ntTSL 215.13■□□□□ 0.012e-10■■■■■ 33.1
PTBP1P26599 PHYKPL-213ENST00000506001 583 ntTSL 313.99□□□□□ -0.172e-10■■■■■ 33.1
PTBP1P26599 PHYKPL-208ENST00000481811 2709 ntTSL 210.93□□□□□ -0.662e-10■■■■■ 33.1
PTBP1P26599 PHYKPL-202ENST00000323594 739 ntTSL 59.19□□□□□ -0.942e-10■■■■■ 33.1
PTBP1P26599 PHYKPL-216ENST00000510991 814 ntTSL 38.26□□□□□ -1.092e-10■■■■■ 33.1
PTBP1P26599 PHYKPL-217ENST00000511716 562 ntTSL 37.82□□□□□ -1.162e-10■■■■■ 33.1
PTBP1P26599 MSI2-212ENST00000579590 452 ntTSL 54.57□□□□□ -1.683e-14■■■■■ 33
PTBP1P26599 KIAA0753-202ENST00000542826 1572 ntTSL 26.8□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 33
PTBP1P26599 KIAA0753-209ENST00000575027 753 ntTSL 46.1□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 33
PTBP1P26599 CEP295-207ENST00000531877 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 24.67□□□□□ -1.665e-9■■■■■ 33
PTBP1P26599 CEP295-205ENST00000531622 219 ntTSL 34.31□□□□□ -1.725e-9■■■■■ 33
PTBP1P26599 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.368e-19■■■■■ 33
PTBP1P26599 SLC35B1-209ENST00000507773 1320 ntTSL 514.84□□□□□ -0.038e-19■■■■■ 33
PTBP1P26599 SLC35B1-202ENST00000435059 910 ntTSL 214.76□□□□□ -0.058e-19■■■■■ 33
PTBP1P26599 SLC35B1-219ENST00000515850 862 ntTSL 513.99□□□□□ -0.178e-19■■■■■ 33
PTBP1P26599 SLC35B1-216ENST00000511763 581 ntTSL 313.05□□□□□ -0.328e-19■■■■■ 33
PTBP1P26599 SLC35B1-204ENST00000502406 1477 ntTSL 211.52□□□□□ -0.568e-19■■■■■ 33
PTBP1P26599 SLC35B1-206ENST00000504260 2424 ntTSL 211.34□□□□□ -0.598e-19■■■■■ 33
PTBP1P26599 SLC35B1-205ENST00000503334 943 ntTSL 39.86□□□□□ -0.838e-19■■■■■ 33
PTBP1P26599 SLC35B1-210ENST00000508520 845 ntTSL 58.17□□□□□ -1.18e-19■■■■■ 33
PTBP1P26599 SLC35B1-218ENST00000514907 633 ntTSL 57.44□□□□□ -1.228e-19■■■■■ 33
PTBP1P26599 SLC35B1-215ENST00000511657 548 ntTSL 37.15□□□□□ -1.268e-19■■■■■ 33
PTBP1P26599 SLC35B1-203ENST00000502268 481 ntTSL 36.19□□□□□ -1.428e-19■■■■■ 33
PTBP1P26599 SLC35B1-213ENST00000508926 393 ntTSL 24.69□□□□□ -1.668e-19■■■■■ 33
PTBP1P26599 EGF-201ENST00000265171 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 33
PTBP1P26599 EGF-206ENST00000509793 4489 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 33
PTBP1P26599 EGF-204ENST00000503392 3642 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 33
PTBP1P26599 TBC1D5-213ENST00000434420 386 ntTSL 43.54□□□□□ -1.842e-7■■■■■ 33
PTBP1P26599 FKBP9-213ENST00000494374 1549 ntTSL 514.61□□□□□ -0.073e-8■■■■■ 33
PTBP1P26599 FKBP9-204ENST00000464334 541 ntTSL 513.76□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 33
PTBP1P26599 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.333e-8■■■■■ 33
PTBP1P26599 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 33
PTBP1P26599 FKBP9-206ENST00000469202 711 ntTSL 412.49□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 33
PTBP1P26599 IGSF23-203ENST00000441389 473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.48□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 33
PTBP1P26599 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.923e-8■■■■■ 33
PTBP1P26599 IGSF23-202ENST00000428245 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.22□□□□□ -0.933e-8■■■■■ 33
PTBP1P26599 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.023e-20■■■■■ 33
PTBP1P26599 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.113e-20■■■■■ 33
PTBP1P26599 MED29-205ENST00000599417 2941 ntTSL 213□□□□□ -0.333e-20■■■■■ 33
PTBP1P26599 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.63e-20■■■■■ 33
PTBP1P26599 MED29-201ENST00000315588 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.653e-20■■■■■ 33
PTBP1P26599 RPRD2-204ENST00000492220 4780 ntTSL 511.14□□□□□ -0.637e-10■■■■■ 33
PTBP1P26599 RPRD2-202ENST00000369068 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.797e-10■■■■■ 33
PTBP1P26599 RPRD2-203ENST00000401000 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.947e-10■■■■■ 33
PTBP1P26599 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.671e-10■■■■■ 33
PTBP1P26599 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.351e-10■■■■■ 33
PTBP1P26599 RALGPS1-202ENST00000319107 770 ntTSL 316.3■□□□□ 0.21e-10■■■■■ 33
PTBP1P26599 RALGPS1-205ENST00000373439 1527 ntTSL 515.99■□□□□ 0.151e-10■■■■■ 33
PTBP1P26599 RERE-207ENST00000464972 743 ntTSL 56.68□□□□□ -1.342e-10■■■■■ 33
PTBP1P26599 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.295e-17■■■■■ 33
PTBP1P26599 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.325e-17■■■■■ 33
PTBP1P26599 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.325e-17■■■■■ 33
PTBP1P26599 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.365e-17■■■■■ 33
PTBP1P26599 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.385e-17■■■■■ 33
PTBP1P26599 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.545e-17■■■■■ 33
PTBP1P26599 RPS6KC1-204ENST00000490299 5154 ntTSL 1 (best)3.58□□□□□ -1.845e-17■■■■■ 33
PTBP1P26599 WDYHV1-207ENST00000523551 853 ntTSL 36.8□□□□□ -1.323e-8■■■■■ 33
PTBP1P26599 WDYHV1-209ENST00000524254 764 ntTSL 35.33□□□□□ -1.563e-8■■■■■ 33
PTBP1P26599 U2AF2-208ENST00000592874 849 ntTSL 512.18□□□□□ -0.464e-9■■■■■ 33
PTBP1P26599 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.15e-13■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.286e-7■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.286e-7■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.366e-7■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 PAFAH1B1-206ENST00000572915 1361 ntTSL 1 (best)5.44□□□□□ -1.545e-13■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 PAFAH1B1-209ENST00000574816 662 ntTSL 54.23□□□□□ -1.735e-13■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 PAFAH1B1-201ENST00000397193 1277 ntTSL 23.86□□□□□ -1.795e-13■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.831e-6■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 AC016687.3-201ENST00000512581 440 ntTSL 32.89□□□□□ -1.951e-6■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 PAFAH1B1-212ENST00000609078 570 ntTSL 42.51□□□□□ -2.015e-13■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.274e-7■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 C14orf159-205ENST00000517306 2294 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 C14orf159-234ENST00000525393 2471 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 C14orf159-226ENST00000523461 2435 ntTSL 210.72□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 CHN2-226ENST00000495789 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.451e-7■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 STAG3L5P-202ENST00000422479 683 ntTSL 27.09□□□□□ -1.274e-15■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 LEPR-204ENST00000371059 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.786e-9■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.566e-9■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.026e-9■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.14e-7■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 LCORL-206ENST00000512376 500 ntTSL 513.61□□□□□ -0.231e-9■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 CREBRF-206ENST00000523161 559 ntTSL 412.51□□□□□ -0.411e-9■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.821e-9■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 CREBRF-205ENST00000522692 2466 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.061e-9■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 TMEM45B-202ENST00000524567 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.071e-9■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 AC079193.2-201ENST00000513892 2292 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.111e-9■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 CREBRF-204ENST00000520464 5163 ntTSL 28.03□□□□□ -1.121e-9■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 SIK3-212ENST00000488337 4220 ntTSL 1 (best)6.24□□□□□ -1.411e-9■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.621e-9■■■■■ 32.9
PTBP1P26599 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.91e-9■■■■■ 32.9
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 171 ms