Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTX3P26022 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTX3P26022 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTX3P26022 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTX3P26022 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTX3P26022 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTX3P26022 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTX3P26022 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTX3P26022 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTX3P26022 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTX3P26022 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTX3P26022 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTX3P26022 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTX3P26022 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTX3P26022 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTX3P26022 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTX3P26022 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTX3P26022 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTX3P26022 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTX3P26022 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTX3P26022 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTX3P26022 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTX3P26022 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTX3P26022 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTX3P26022 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTX3P26022 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTX3P26022 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTX3P26022 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTX3P26022 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTX3P26022 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTX3P26022 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTX3P26022 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTX3P26022 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTX3P26022 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTX3P26022 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTX3P26022 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTX3P26022 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTX3P26022 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTX3P26022 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTX3P26022 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTX3P26022 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms