Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYF6P23409 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYF6P23409 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYF6P23409 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYF6P23409 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYF6P23409 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYF6P23409 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYF6P23409 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYF6P23409 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYF6P23409 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYF6P23409 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYF6P23409 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYF6P23409 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYF6P23409 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYF6P23409 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYF6P23409 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYF6P23409 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYF6P23409 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MYF6P23409 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYF6P23409 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYF6P23409 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYF6P23409 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYF6P23409 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYF6P23409 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYF6P23409 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYF6P23409 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms