Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms