Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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RAB5AP20339 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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RAB5AP20339 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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RAB5AP20339 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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RAB5AP20339 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RAB5AP20339 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RAB5AP20339 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RAB5AP20339 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RAB5AP20339 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RAB5AP20339 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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