Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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