Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms