Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP3P12645 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BMP3P12645 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BMP3P12645 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BMP3P12645 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BMP3P12645 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BMP3P12645 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BMP3P12645 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BMP3P12645 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BMP3P12645 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BMP3P12645 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP3P12645 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP3P12645 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP3P12645 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP3P12645 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP3P12645 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP3P12645 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP3P12645 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP3P12645 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP3P12645 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP3P12645 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP3P12645 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP3P12645 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP3P12645 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP3P12645 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP3P12645 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP3P12645 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP3P12645 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP3P12645 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP3P12645 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP3P12645 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP3P12645 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP3P12645 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP3P12645 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP3P12645 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP3P12645 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP3P12645 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP3P12645 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP3P12645 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP3P12645 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP3P12645 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP3P12645 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP3P12645 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMP3P12645 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMP3P12645 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMP3P12645 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms