Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB1P11230 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms