Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0C879 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0C879 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P0C879 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P0C879 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms