Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms