Protein–RNA interactions for Protein: P01861

IGHG4, Immunoglobulin heavy constant gamma 4, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG4P01861 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG4P01861 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms