Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD4O95243 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD4O95243 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD4O95243 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD4O95243 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD4O95243 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD4O95243 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD4O95243 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD4O95243 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD4O95243 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD4O95243 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD4O95243 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD4O95243 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD4O95243 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD4O95243 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD4O95243 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD4O95243 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD4O95243 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD4O95243 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD4O95243 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD4O95243 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD4O95243 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD4O95243 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD4O95243 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD4O95243 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD4O95243 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD4O95243 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD4O95243 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MBD4O95243 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MBD4O95243 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD4O95243 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms