Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF4AO95239 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF4AO95239 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms