Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAMTA2O94983 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms