Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA10O75578 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms