Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms