Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9AO75110 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms