Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSCO60682 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSCO60682 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MSCO60682 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSCO60682 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSCO60682 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSCO60682 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSCO60682 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSCO60682 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSCO60682 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSCO60682 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSCO60682 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MSCO60682 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSCO60682 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSCO60682 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSCO60682 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSCO60682 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSCO60682 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSCO60682 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSCO60682 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MSCO60682 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MSCO60682 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms