Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPLO60437 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPLO60437 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPLO60437 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPLO60437 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPLO60437 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPLO60437 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PPLO60437 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPLO60437 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPLO60437 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPLO60437 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPLO60437 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPLO60437 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPLO60437 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPLO60437 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPLO60437 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPLO60437 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPLO60437 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PPLO60437 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPLO60437 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPLO60437 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPLO60437 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPLO60437 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPLO60437 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPLO60437 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PPLO60437 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPLO60437 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPLO60437 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPLO60437 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPLO60437 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPLO60437 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPLO60437 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPLO60437 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PPLO60437 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPLO60437 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PPLO60437 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPLO60437 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPLO60437 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPLO60437 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPLO60437 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPLO60437 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PPLO60437 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPLO60437 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPLO60437 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPLO60437 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPLO60437 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPLO60437 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPLO60437 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPLO60437 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPLO60437 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPLO60437 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPLO60437 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPLO60437 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPLO60437 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPLO60437 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPLO60437 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPLO60437 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPLO60437 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PPLO60437 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPLO60437 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPLO60437 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPLO60437 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPLO60437 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPLO60437 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPLO60437 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PPLO60437 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PPLO60437 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPLO60437 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPLO60437 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPLO60437 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPLO60437 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPLO60437 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPLO60437 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPLO60437 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPLO60437 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPLO60437 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPLO60437 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPLO60437 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPLO60437 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPLO60437 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPLO60437 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPLO60437 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPLO60437 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPLO60437 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms