Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms