Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH3O43739 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms