Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms