Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTIFO43310 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTIFO43310 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTIFO43310 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTIFO43310 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTIFO43310 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTIFO43310 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTIFO43310 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTIFO43310 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTIFO43310 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTIFO43310 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTIFO43310 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTIFO43310 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTIFO43310 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTIFO43310 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTIFO43310 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTIFO43310 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTIFO43310 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTIFO43310 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CTIFO43310 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTIFO43310 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTIFO43310 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTIFO43310 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTIFO43310 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTIFO43310 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTIFO43310 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTIFO43310 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTIFO43310 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTIFO43310 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTIFO43310 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTIFO43310 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTIFO43310 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTIFO43310 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTIFO43310 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTIFO43310 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTIFO43310 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTIFO43310 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTIFO43310 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTIFO43310 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTIFO43310 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTIFO43310 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTIFO43310 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTIFO43310 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTIFO43310 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTIFO43310 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTIFO43310 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTIFO43310 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTIFO43310 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTIFO43310 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTIFO43310 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTIFO43310 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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