Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms