Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PODXLO00592 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PODXLO00592 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PODXLO00592 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PODXLO00592 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PODXLO00592 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PODXLO00592 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PODXLO00592 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PODXLO00592 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PODXLO00592 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PODXLO00592 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PODXLO00592 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PODXLO00592 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PODXLO00592 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PODXLO00592 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PODXLO00592 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PODXLO00592 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PODXLO00592 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PODXLO00592 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PODXLO00592 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PODXLO00592 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PODXLO00592 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PODXLO00592 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PODXLO00592 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PODXLO00592 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PODXLO00592 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms