Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms