Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms