Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPIPB9F8W1W9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms