Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L13C9JLJ4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L13C9JLJ4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L13C9JLJ4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L13C9JLJ4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L13C9JLJ4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L13C9JLJ4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L13C9JLJ4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L13C9JLJ4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L13C9JLJ4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L13C9JLJ4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L13C9JLJ4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L13C9JLJ4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L13C9JLJ4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L13C9JLJ4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L13C9JLJ4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L13C9JLJ4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L13C9JLJ4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms