Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms