Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms