Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms