Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG8

C2orf71, Uncharacterized protein C2orf71, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf71A6NGG8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf71A6NGG8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf71A6NGG8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms