Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC182A6NF36 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms