Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GOLGA6L9A6NEM1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms