Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMNCA6NCL1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms