Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms