Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms