Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms