Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AC013275.1-202ENST00000457436 501 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 LINC02148-201ENST00000503877 1223 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 SUMO2P17-201ENST00000504438 285 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 ERLIN2-210ENST00000523107 771 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AC087521.3-202ENST00000526408 743 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AC010542.3-202ENST00000561728 701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AP001025.3-201ENST00000578787 864 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 RN7SL155P-201ENST00000581538 263 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 MKNK2-211ENST00000591142 875 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 RN7SL113P-201ENST00000619959 299 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 PLCE1-AS2-202ENST00000432782 1612 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 OR14I1-201ENST00000342623 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 OR11G2-201ENST00000357366 1038 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 RNU1-11P-201ENST00000383975 164 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 MS4A3-203ENST00000395032 867 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AL161787.1-201ENST00000401543 174 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 SOX9-AS1-203ENST00000424417 576 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC108448.2-201ENST00000431546 730 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AL139237.1-201ENST00000446107 513 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 ADAM3A-206ENST00000484602 1046 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 EFCAB10-204ENST00000485614 799 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 ACTG1P20-201ENST00000486001 468 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC104123.1-202ENST00000511775 581 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 RNU7-179P-201ENST00000516608 68 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 FAXDC2-206ENST00000518651 536 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC003991.2-201ENST00000520993 576 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC022239.1-201ENST00000527922 435 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC114546.2-201ENST00000560683 477 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 AC069499.2-201ENST00000610665 382 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 TUG1_3.1-201ENST00000616187 237 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 MED15P6-202ENST00000621415 787 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC105339.4-201ENST00000624471 737 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 AC119674.1-221ENST00000641594 1213 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 MYB-235ENST00000533624 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 MYB-238ENST00000534044 1812 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 ANGPT2-203ENST00000523120 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 GLRX-201ENST00000237858 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 KRTAP6-2-201ENST00000334897 313 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AL080285.1-201ENST00000404225 984 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AL035698.1-201ENST00000405812 564 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 RN7SKP26-201ENST00000410247 293 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 SMIM12-201ENST00000417239 684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 NEFLP1-201ENST00000436364 984 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 LINC00489-201ENST00000457816 543 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 PPIAP28-201ENST00000458378 485 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC091839.1-201ENST00000513087 269 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 GAPDHP44-201ENST00000513513 1007 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 LINC01170-201ENST00000519703 406 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 PTK2-241ENST00000522950 548 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 USP2-AS1-203ENST00000530002 764 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 PSMA6-202ENST00000540871 912 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC087241.3-201ENST00000542076 862 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 LINC01397-201ENST00000554808 579 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 OR1P1-201ENST00000571766 994 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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